Ces édifices présentent souvent une structure stromatolithique.

Les bactéries sont les principaux constructeurs stromatolithiques. La structure des stromatolithes est caractérisée par la précipitation de carbonate de calcium formant des couches superposées qui correspondent à la croissance de nombreuses colonies microbiennes successives. (J. Casanova, 1985 ; C.L.V. Monty, 1986).

Le processus est probablement le suivant : la photosynthèse cyanobactérienne, ici en zone photique, est activée par les venues de sels minéraux (Ca²⁺), de CO₂ et par la température. La matière organique ainsi produite est ensuite transformée en carbonate par les bactéries carbonatogènes hétérotrophes.